Modře značená turistická trasa začíná u železniční stanice Kubova Huť. Přejdeme koleje a stoupáme od západu na Boubín, za nádražím po levé straně stojí kryt (zbytek předválečného opevnění ze 30. let). Lesní cestou se stoupá vzhůru, po levé straně je výhled na Vimpersko. Cestou přijdeme k trojhrannému Johnovu kamenu, který nese název podle knížecího lesmistra Josefa Johna (velkou měrou zasloužil o zřízení Boubínského pralesa). Kámen stojí na rozhraní tří polesí a to Zátoň, Kubova Huť a Včelná. Za Johnovým kamenem se jde nejprve po rovině a potom se prudce stoupá na 1362 m. n. m. vysoký vrchol Boubína. Na vrcholovém kameni čteme nápis: "Kardinál Friedrich Fürst von Schwarzenberg 3. 8.1867". Návštěva kardinála v těchto místech byla ve své době považována za mimořádný výkon, a tak byla oceněna zbudováním pomníku. Výhled z vrcholu je bohužel z velké části zakryt stromy. Kromě pohledu na Prachaticko je vidět vedlejší vrchol Bobíka.
Opustíme Boubín a po modré prudce klesáme až na Lukenskou cestu (sousedí s plotem obory na chov jelení zvěře). Pod rozcestím přijdeme lesem k dalšímu trojbokému kamenu s názvem Křížová Smrč. Klesáme po asfaltové cestě, odbočíme a po modré klesáme prudkou lesní cestou až k Boubínskému pralesu. Jdeme proti směru naučné stezky až přijdeme k Boubínskému jezírku. Můžeme zde vidět Krále smrků a chůdové kořeny, které patří k nejzajímavějším zvláštnostem Národní přírodní rezervace. Od Boubínského jezírka klesáme údolím Kaplického potoka, po 1 km odbočíme vpravo a vystoupáme zpět na Lukenskou cestu, procházející krásnými smíšenými lesy. Při mírném klesání k Zátoni spatříme další z mnoha boubínských pomníčků, míjíme Soví skálu. Zbytek cesty nás zavede do železniční stanice Zátoň zastávka.